В большинстве случаев ошибка Internal Server Error вызвана неверной конфигурацией Nginx. Так что используйте лучшие практики по настройке веб-сервера. И не забудьте включить логирование ошибок - обычно Nginx подсказывает причину ошибки в журнале.
Но есть и не очевидная причина проблемы. Если Nginx работает вместе с PHP-FPM (через модуль FastCGI), то ошибку 500 сервера могут вызывать ошибки выполнения PHP, если отключена директива display_errors.
Для начала проверьте лог php-fpm:
tail -f /var/log/php-fpm/www-error.log
А затем проверьте файл конфигурации /etc/php-fpm.d/www.conf.
Еще одна возможная причина ошибки - скрипт пытается использовать больше памяти, чем позволяет директива memory_limit. На ошибку укажет лог PHP-FPM, а увеличить лимит можно все в том же файле конфигурации /etc/php-fpm.d/www.conf.